Родился 12 февраля 1898 года в Харбалахском наслеге Верхневилюйского улуса Якутской области в семье крестьянина-скотовода. Учился в учительской семинарии в г. Якутске, где знакомится с Е. М. Ярославским, занимается в его революционном кружке.
Член РСДРП с сентября 1917 года.
1918—1920 гг. – отбывал ссылку в Иркутской области, работал учителем;
1920—1922 гг. – секретарь Якутского губернского, Вилюйского уездного бюро РКП(б);
1922—1924 гг. – председатель Совнаркома ЯАССР;
1926—1928 гг. – первый секретарь Якутского обкома ВКП(б);
1928—1933 гг. – учился в Институте красной профессуры;
1933—1938 гг. – заместитель, заведующий сектором Восточной Сибири и Дальнего Востока сельхозотдела ЦК ВКП(б).
Делегат X, XII, XV съездов партии, избирался членом ЯЦИК, ЦИК СССР.
В 1938 году репрессирован по ложному обвинению и 15 сентября этого же года расстрелян в окрестностях Москвы.
Реабилитирован 31 октября 1956 года.
Имя И. Н. Барахова присвоено Верхневилюйской средней школе № 1, улицам Якутска, Верхневилюйска и др. населённых пунктов.
Именем Исидора Барахова названо новое судно проекта «Советская Якутия», построенное в 1974 г.
27 апреля 2014 г. в Якутске открыт памятник И. Барахову.